El área de Herpetología de la Colección Boliviana de Fauna se propone incrementar el conocimiento científico sobre los anfibios, reptiles y otras especies relacionadas con la herpetofauna existente en Bolivia. Esta información permitirá aumentar la lista de la herpetofauna de Bolivia, ampliar la distribución de estas especies y conocer más acerca de las características de cada una de ellas. Además, esta información, nos permitirá crear diferentes líneas de investigación dentro del área de investigación.

En la actualidad se está desarrollando diferentes proyectos por parte de los investigadores y al mismo tiempo nuestros investigadores están participando en diferentes proyectos, y uno de los más grandes es el que se está realizando por Identidad Madidi.

El área de Herpetología no sólo abarca a investigadores ya profesionales, si no a estudiantes de la carrera de Biología de la UMSA incentivándolos a formar parte de proyectos con el objetivo de que lo mismos, en un futuro, puedan desarrollar sus propios proyectos en las líneas de investigación de preferencia para ellos. Esto permite desarrollar el criterio científico en cada uno de los ayudantes que forman parte del área.