Sekolah Dasar Islam Terpadu (SDIT) Al-Fathonah merupakan sekolah dasar yang menerapkan nilai-nilai Qur'ani dengan sistem pengajaran modern, berakhlak mulia, berdisiplin tinggi, berwawasan luas dan bersikap terbuka dan kritis dengan ciri khas Everyday with Qur'an, Keteladanan dan Kepioniran, Komunikatif Interventif, Leadership dan Membership, Enterpreunership, membentuk putra-putri muslim seutuhnya sebagai generasi bangsa dan warga masyarakat dunia