Het Wajangmuseum is een museum in Indonesië gewijd aan wajang. Het museum ligt aan het plein Taman Fatahillah in Jakarta.
Het museum, geopend in 1975, heeft een collectie van verschillende soorten wajang, zoals wajang koelit en wajang golèk. Het toont ook verschillende collecties van wajang en poppen uit landen als Maleisië, Thailand, Suriname, China, Vietnam, Frankrijk, India en Cambodja. Het museum toont ook gamelansets, wajangsculpturen en wajangschilderijen.
Het museum is gevestigd op de plek waar voorheen de Oude Hollandsche Kerk stond. De herdenkingsteen aan Jan Pieterszoon Coen herinnert hier nog aan.